秦直道沿线的烽隧断代除了陕西境内己经进行考古发掘的五里墩烽隧、南桂花烽隧可进行初步断代之外，其余的烽隧根据遗址四周散存的遗物及烽隧的夯层厚度对烽隧进行初步的年代推断。由于道路的考古发掘还比较薄弱，针对秦直道沿线存在的多座烽隧，都进行考古发掘来断代，有一定的难度，所以通过文物普查的方式对秦直道沿线的烽隧数据、出土遗物、夯层厚度等进行统计记录是具有可行性的，利用这些数据对烽隧进行初步的年代推断在目前看来是合理的，但是还需要之后的学者对烽隧进行实地考古发掘来不断订正。
(一)陕西境内秦直道沿线烽隧遗址年代推断
在陕西境内，保存秦直道沿线烽隧遗址的地区主要有旬邑县、安塞县、黄陵县、富县、甘泉县和志丹县，根据《中国文物地图集·陕西分册》中记载有旬邑县秦直道沿线烽隧遗址有:黑麻湾烽隧遗址、转角烽隧遗址、土窑烽隧遗址，3座烽隧遗址年代初步推断全部为秦汉时期。黄陵县秦直道沿线烽隧遗址有:艾篙店烽隧遗址、五里墩烽隧遗址、五里墩东烽隧遗址、五里墩西烽隧遗址、老卢保烽隧遗址、兴隆关烽隧遗址，6座烽隧遗址年代为秦汉时期，另外一座南桂花烽隧，考古发掘中未见到任何时期的遗物，根据夯层厚度可初步推断为宋元。
富县秦直道沿线烽隧遗址有1处:五里铺烽隧遗址，烽隧遗址年代为秦汉时期。
甘泉县秦直道沿线烽隧遗址有:墩梁烽隧遗址，根据夯层厚度是8-10厘米及采集的标本戳印纹陶片、板瓦残片，初步推断年代为秦汉时期。志丹县秦直道沿线烽隧遗址有:白杨树湾烽隧遗址、柠条湾烽隧遗址、杨崖根烽隧遗址，3座烽隧遗址年代全部为秦汉时期，另外一座白草湾烽隧，夯层厚度统计是10-20厘米，未发现任何遗物，根据夯层厚度推断可能是秦汉时期修筑，后世加筑。安塞县秦直道沿线烽隧遗址有:堡山烽隧遗址、东里畔烽隧遗址、贺庄烽隧遗址、阳山梁烽隧遗址、高山郧烽隧遗址、新庄烽隧遗址、宋家狐烽隧遗址，7座烽隧遗址年代全部为秦汉时期。
(二)甘肃境内秦直道沿线烽隧年代推断
甘肃境内，保存有秦直道沿线烽隧遗址的地区主要有正宁县、宁县、合水县、华池县。除了标明有确切年代的烽隧遗址之外，可根据夯层厚度、出土遗物及形制对比来推断烽隧的年代。
明确修筑年代为秦代的烽隧遗址有:刘家店烽隧遗址、黑麻湾烽隧遗址、杠树烽隧遗址、椿树庄烽隧遗址、南梁}P烽隧遗址、调令关烽隧遗址、艾篙店烽隧遗址、卢邑庄烽隧遗址、午亭子东寨烽隧遗址、午亭子中寨烽隧遗址、涧水坡岭障城遗址、老爷岭烽隧遗址、黄篙地畔烽隧遗址、打扮障城遗址、墩梁烽隧遗址、杜树咀烽隧遗址、梨树掌一号烽隧遗址、梨树掌二号烽隧遗址、营噜现一号烽隧遗址、营噜现二号烽隧遗址、营噜现三号烽隧遗址、营噜现四号烽隧遗址、营噜现五号烽隧遗址、营噜现六号烽隧遗址、林沟障城遗址、白涧一号烽隧遗址、白涧二号烽隧遗址、白涧三号烽隧遗址、墩尔梁烽隧遗址，共29座烽隧遗址。
除了标明确切年代的烽隧遗址外，根据本章第二节甘肃境内秦直道沿线烽隧一览表可知，秦直道沿线的烽隧遗址四周发现有粗、细绳纹板瓦、筒瓦残片，并结合烽隧的夯层厚度，可推断烽隧遗址的年代。粗、细绳纹板瓦、筒瓦是秦汉时期较为常用的建筑材料，较多地发现于凤翔秦雍城遗址、秦汉栋阳城遗址、秦汉骊山汤遗址、陕西千阳尚家岭秦汉建筑遗址等，战国晚期和秦代多流行细绳纹瓦片，汉代则多流行粗绳纹瓦片。目前考古界也根据夯层厚度推断年代，秦汉时期建筑的夯层厚度在6-11厘米，以厚度为6,7,8厘米最为常见。据此并结合这些烽隧遗址处在秦直道沿线，可推断，四周残存粗细绳纹板瓦、筒瓦残片的烽隧修筑年代最早应为秦汉时期。
明确记载在烽隧四周发现有粗、细绳纹板瓦、筒瓦残片并且夯层厚度在6-11厘米的烽隧遗址有:南五里墩烽隧遗址、七里店烽隧遗址、午亭子西寨烽隧遗址、西梁一号烽隧遗址、三烽梁三号烽隧遗址、营盘梁一号烽隧遗址、营盘梁二号烽隧遗址、营盘梁三号烽隧遗址、四墩梁三号烽隧遗址、烨尖咀烽隧遗址、四涧梁烽隧遗址、二涧一号烽隧遗址、二涧二号烽隧遗址、王掌烽隧烽隧遗址、小山湾一号烽隧遗址、小山湾二号烽隧遗址、南湾一号烽隧遗址、南湾二号烽隧遗址、南湾三号烽隧遗址、南湾五号烽隧遗址、南湾六号烽隧遗址、刘梁二号烽隧遗址、刘梁三号烽隧遗址、高湾一号烽隧遗址、高湾二号烽隧遗址、高湾三号烽隧遗址、箱子湾二号烽隧遗址、赵梁烽隧遗址，共28座烽隧遗址。推断这28座烽隧遗址的修筑年代为秦汉时期。
还有一部分烽隧因没有出土遗物的记载，可根据烽隧的夯层厚度及自身的形制与己确定年代的烽隧形制对比来推断其年代。
秦直道从午亭子向西北沿子午岭主峰山脊西行，经土桥、条囤湾、槐树原、庙湾、梨树湾、马莲噜现、佘家庄、朱家老湾、冯家梁、娘母子湾、墩台山、油房庄、田家沟掌、熊家岭到涧水坡岭，以上各地区都留存有一座烽隧，根据午亭子西寨烽隧推断年代，午亭子西寨烽隧四周发现有粗绳纹瓦残片，夯筑，夯层厚度为8厘米，推断其年代为秦汉时期，其烽隧形制:形状为圆锥状、残高3米，底周长28米，顶径长3米，夯筑，夯层厚度为8厘米。
土桥烽隧遗址、条囤湾烽隧遗址、槐树原烽隧遗址、庙湾烽隧遗址、梨树湾烽隧遗址、马莲噜现烽隧遗址、佘家庄东岭烽隧遗址、朱家老湾烽隧遗址、冯家梁烽隧遗址、娘母子湾烽隧遗址、墩台山烽隧遗址、油房庄烽隧遗址、田家沟掌烽隧遗址、熊家岭烽隧遗址，以上14座烽隧遗址形制:形状全部为圆锥状、残高4-7.2米、底周长32-61米、顶径长2-3.5米、夯筑、夯层8厘米，与午亭子西寨烽隧遗址形制无异，可推断以上14座烽隧遗址修筑年代最早为秦汉时期。
秦直道从涧水坡岭向西北沿子午岭主峰经黄草噜现、青龙山、桃花庄、木瓜岭、宋家沟恼、梨树庄、太阳坡分岔处、墩梁、上大树原、杨岭子到麻子噜现。以上个点均有烽隧，这11座烽隧，形制如下:形状为圆锥形、残高5-8米、底周长40-61米、顶径长3-4米、夯筑、夯层8厘米，与己确定年代为秦汉时期的椿树庄烽隧形制无异，所以推断这11座烽隧修筑年代最早为秦汉时期。
直道从墩掌向西北沿子午岭主峰山脊行进，经墩掌、杜梨树掌，直达梨树掌，从梨树掌娅口通过，经东麦地湾、东涧、墩儿梁、西涧、背庄梁、西梁、碾子畔、董涧、林沟障、东二涧、曹畔、四墩梁、三涧、大涧、城梁盖、赵梁至白涧。以上各地区都留存有烽隧遗址，尚未确定年代的烽隧有东麦地湾一号、二号烽隧遗址、东涧一号、二号、三号、四号烽隧遗址、墩儿梁烽隧遗址、西涧烽隧遗址、背庄梁烽隧遗址、西梁二号烽隧遗址、碾子畔一号、二号烽隧遗址、三烽梁一号、二号烽隧遗址、董涧一号、二号烽隧遗址、东二涧烽隧遗址、曹畔一号、二号烽隧遗址、四墩梁一号、二号烽隧遗址、三涧烽隧遗址、大涧烽隧遗址、南湾四号烽隧遗址、城梁盖一号、二号烽隧遗址、箱子湾一号、三号烽隧遗址，白涧二号、白涧三号共30座烽隧遗址，这30座烽隧形制:形状为圆锥形、残高1.5-7.2米、底周长12-41米，顶径长1.5-6米，夯筑，夯层为7-8厘米，与己推断年代的杠树郧烽隧形制无异，可推断这30
另外，秦汉时期修筑被后世沿用、加筑的烽隧遗址有6座烽隧:调令关烽隧遗址，四周残存有粗、细绳纹瓦片、秦汉至宋代的瓷器残片。艾篙店烽隧遗址，四周散存粗、细绳纹瓦及瓷器残片。卢邑庄烽隧，夯筑，夯层8厘米，烽隧四周残存大量的粗、细绳纹瓦残片和宋元瓷器残片。七里店烽隧，夯筑，夯层8厘米，烽隧四周残存大量粗、细绳纹瓦残片，唐、宋、元瓷残片。午亭子西寨烽隧，夯筑，夯层8厘米，遗址有大量粗绳纹残片，唐、宋、元瓷残片。黄篙地畔烽隧，夯筑，夯层8厘米，烽隧四周除了发现了秦汉时期的残瓦片，还发现有唐、宋、元、明瓷器残片。说明此烽隧自修筑之后一直为后世所沿用，不排除有后世加筑现象。
陕西境内秦直道沿线23座烽隧遗址中，22座烽隧年代初步推断为秦汉，南桂花烽隧年代不确定。甘肃境内秦直道沿线的座烽隧，可以初步推断年代为秦汉时期修筑的就有座，其中6座烽隧遗址根据采集的遗物可推断烽隧自修筑之后被后世沿用、加筑。
